填料是生物膜反应器的中心组成部分，影响着技术的处理效果和运转操控，故挑选适宜的填料对生物膜反应器非常重要。从前外通常选用的填料形状有蜂窝管状、束状、波纹状、圆形辐射状、盾状、网状、筒状、规矩粒状与不规矩粒状等，效果的资料除粒状填料外基本上都选用玻璃钢、聚氯乙烯、聚丙烯、维尼纶等。因为制作加工和经济要素。

目前要选用的填料为塑料或玻璃钢蜂窝填料、立体波状填料、软性纤维填料、半软性填料、塑料或玻璃钢蜂窝填料外表光滑，生物膜附着率差，易老化.且在实际使用中通常简单发生填料阻塞。软性填料中的水流流态不抱负，易被微生物膜猫结在一同，发生结球景象，使其有用外表积大为减小，进而在结球的内部发生厌氧景象，影响处理效果。

微生物固定化资料制成的填料或陶粒滤料的几许形态直接决议其比外表积的巨细。通常情况下，单个生物膜填料和滤料的空间体积越大，其所具有的比外表积越小。其相对密度影响处理构筑物的建造费用及能耗，若相对密度越大，则需求更多的进步动力，一起也因过强的水力剪切而影响微生物固定。生物膜填料外表的孔隙率及外表粗糙程度直接影响生物膜的形成、开展及安稳进程。添加填料与微生物触摸的有用面积可以维护固定微生物免受水力剪切效果，减缓因为填料间的碰撞所形成的微生物丢失速度，在某种程度上有利于传质功率的进步。